乔家次子乔森在接受“灵种”仪式后，启迪了“灵植物”以发展精神技能。在这个过程中，乔森先后遇到了家中长辈的女儿田碧瑶、黑龙会的年轻刺客霍秉立和冯家的长女冯舞阳。与此同时，若森收集灵石，开辟精神通道，扩展更多的精神植物，展现出非凡的潜力，并成为剑山城六门的侦察员。在一起经历了生死之后，乔森和田碧瑶交换了秘密，帮助冰丽重新发现自己的生活，并脱离了黑龙会，引起了冯舞阳的注意。为此，他曾多次与黑龙会刺客对抗，甚至见过邪恶终极派等大门派的低级弟子的傲慢和自大。作为一名秘密巡逻员，乔纳森迅速积累灵石，提高修炼速度，并启迪更多的精神植物。在这一点上，乔森展示的资质吸引了神秘力量的注意。金刚寺的僧人应真武派道士的邀请前来参观，大黑天、血刃派等邪恶教派也纷纷前来。约翰逊后来了解到，黑灵种子与古代失落的派系“上清”有关，邪恶势力黑龙协会想要获得宝藏并统治世界。在寻找线索的过程中，乔森和彬丽多次并肩作战，从敌人变成了朋友，直到他们的爱人。与此同时，Jonathan觉得像照顾妹妹一样照顾他的田碧瑶也有一种隐藏的感情。因此，他们三人共同踏上了阻止黑龙会获得上清仙派遗迹并称霸世界的旅程。
